C'est à peu près comme ça que je fais, notamment avec les "Files de travail" (workflow) de Bibble, ce qui aide vraiment.

Un conseil, pour vos dossiers, en tout cas moi, je les classes par date et par thème, ce qui fait que, si j'ai fait de la macro d'insecte le 25 décembre 2007, ça donnera un dossier appelé "071225 Macro insectes" (YYMMDD), ça fait que l'explorer lui-même sait classer par date nos photos.
Vous pouvez même rajouter après la date un "a" ou un "m" pour matin ou après-midi, cela sera aussi classé par date